STIC et Vivant : Sciences et Techniques de l’Information et de la Communication & Sciences du Vivant

Responsables : G. Barlovatz, H. Maaref

Cet axe développe des méthodes et des outils issus de l’informatique, du traitement de signal, du traitement de données et de l’automatique pour les appliquer à des problèmes d’origine biologique. Le terme biologique est à prendre dans un sens très large : il commence à la molécule et se termine à l’être humain en passant par la cellule et l’organe. Les travaux de recherche se concentrent sur :

• l'apprentissage automatique, la classification et l'analyse de données ;
• l'intégration de données biologiques hétérogènes par les systèmes de médiation ;
• l’analyse d’image et le traitement du signal, en particulier pour le domaine biomédical ;
• la biométrie et la bio-identification (applications aux données du visage et de l'iris) ;
• l’assistance et l’interaction avec les personnes dépendantes (dans une perspectives cognitiviste)
• la modélisation de processus complexes et/ou de structures biologiques à différentes échelles (en particulier en physiologie rénale) ;
• la production expérimentale de données biologiques et la modélisation des precessus étudiés (micro-environnement cellulaire, migration, processus métastatique) ;
• la visualisation de données.

L’intégration d’une équipe de biologie expérimentale est effective depuis janvier 2005. La poursuite de cette intégration dans le nouveau laboratoire IBISC permet de concrétiser et renforcer encore les liens privilégiés tissés sur Evry entre informatique et biologie dans le domaine de la modélisation, en offrant un cadre qui permette d’appliquer et de développer des outils issus de l’informatique, de l’automatique et du traitement du signal sur des problèmes biologiques fondamentaux (la mobilité cellulaire, le métabolisme du rein). Ces problèmes constituent des défis qui nécessitent une collaboration à long terme et qui ont de très nombreuses retombées (en particuliers des retombés médicales dans le traitement du cancer).

Les équipes-projets de l'axe SIV

L'axe STIC et Vivant se structure en quatre équipes-projets :

• Equipe-projet AMIS-Bio : Apprentissage, Modélisation et Intégration pour les Systèmes Biologiques, responsable F. d’Alché-Buc
• Equipe-projet Dynamic : DYNAMIque du micro-environnement Cellulaire, responsable G. Barlovatz
• Equipe-projet HANDS : HANDicap et Santé, responsable E. Colle
• Equipe-projet TADIB : TrAitement de Données et d’Images – Biométrie, responsable H. Maaref

Animation scientifique

L’axe SIV se propose d’organiser une rencontre annuelle «STIC et Vivant» au cours de laquelle une thématique scientifique, émergeant des recherches au sein des équipes d’IBISC, serait confrontée à l’expérience de chercheurs extérieurs au laboratoire. L’optique croisée des disciplines relevant des STIC et/ou de la Biologie, favoriserait la vision intégrative que nous voulons promouvoir. Parmi les thématiques déjà proposées, figurent la reconnaissance de formes, ainsi que l’idée d’une rencontre «Nano-Meca-Bio». L’appartenance de plusieurs d’entre nous au GDR «STIC-Santé», nous permet de rencontrer des chercheurs de tout l’hexagone travaillant sur des thématiques qui peuvent également croiser les problématiques développées au sein de notre axe.

Projets de recherche communs

Projets intra-axe

• projet STEP (Strategy Towards the European Physiome) : action de coordination européennes, équipes Dynamic et AMIS-Bio
• projet FAME2 : dans le pôle de compétitivité SYSTEM@TIC, équipes AMIS-Bio et Dynamic
• projet MOBILE : équipes Dynamic et TADIB

Projets inter-axes

• projet AFM ARPH : équipe HANDS et VASCO
• projet ANR BIOSYS SAPHIR : équipes Dynamic, AMIS-Bio et LIS
• projet MOVE’O “Handicap et Mobilité” : équipes HANDS et VASCO
• BQR Visualisation : équipes LIS, TADIB, RATC et ATIGE VIM-Bio
• projet Mic & Movie : équipes Dynamic, TADIB et LIS
• PPF interne jeux.stic : équipes Opal, Dynamic, TADIB et VASCO